一般情况下，想要通过手机交农村合作医疗保险费，需要当地医保部门推出了相关缴费渠道，如手机APP、微信公众号、官网等，具体需要咨询当地的相关部门。若是不通过手机缴费，可以找当地村干部代缴，或者到医保部门实地缴费。
具体缴纳方式如下：
1.官网缴费步骤：登录当地所处城市的社会保险网上申报服务平台，进入网上自助缴费界面，输入姓名、身份证号码，阅读接受打钩，点击发送短信验证码，输入验证码进行查询，之后会显示参保人相关信息，确认无误后就可以点击支付，支付完成后记得查看缴费结果。
2.微信缴费步骤：打开手机微信APP，点击右下角“我”—支付—生活缴费—社保医保—选择XX省/市城乡居民医疗保险—正确输入参保人的身份证号码、姓名—点击确认缴费编号—点击下一步—立即缴费，显示“缴费成功”就完成了。
3.支付宝缴费步骤：打开手机支付宝APP，点击主界面市民中心—办事大厅—社保—居民医保缴费—正确输入参保人的身份证号码、姓名—点击确认缴费编号—点击下一步—立即缴费，显示“缴费成功”就完成了。
国家建立和完善新型农村合作医疗制度。 新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。还可以通过微信方式缴费，流程与步骤与支付宝缴费是一样的。根据相关法律规定可知，无雇工的个体工商户、未在用人单位参加社会保险的非全日制从业人员，以及其他灵活就业人员，可以直接向社会保险费征收机构缴纳社会保险费。
法律依据《中华人民共和国社会保险法》
第六十条用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免。职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴，用人单位应当按月将缴纳社会保险费的明细情况告知本人。 无雇工的个体工商户、未在用人单位参加社会保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员，可以直接向社会保险费征收机构缴纳社会保险费。
