自然资源部临时用地管理办法如下：
1.临时用地不得占用土地利用总体规划确定的基本农田，国家和省批准立项的交通、能源、水利、军事设施等项目建设施工确需占用的，必须严格控制；申请临时用地应当合理选址，可利用非耕地的，不占用耕地，可利用劣质耕地的，不占用优质耕地，不得影响近期建设规划或者控制性详细规划的实施，不得妨碍道路交通、损坏水利等公共设施，不得造成安全隐患；
2.临时使用土地由县级国土资源行政主管部门批准，其中涉及基本农田5亩、耕地10亩以上的，需报设区市国土资源行政主管部门备案；临时使用土地合同由临时用地申请人与提供临时用地的权利人签订；
3.临时使用农用地的，应当签订临时用地复垦协议，编制土地复垦方案，对可能因挖损、塌陷、占压等原因破坏的土地范围、面积、地类和程度等进行科学合理预测，提出土地复垦的技术路线和方法，明确土地复垦的时间，落实土地复垦费用措施等。
其中，在城市规划区内的临时用地，在报批前，应当先经有关城市规划行政主管部门同意。土地使用者应当根据土地权属，与有关自然资源主管部门或者农村集体经济组织、村民委员会签订临时使用土地合同，并按照合同的约定支付临时使用土地补偿费。
建设项目施工和地质勘查需要临时使用国有土地或者农民集体所有的土地的，由县级以上土地行政主管部门批准。其中，在城市规划区内的临时用地，在报批前，应当先经有关城市规划行政主管部门同意。土地使用者应当根据土地权属，与有关土地行政主管部门或者农村集体经济组织、村民委员会签订临时使用土地合同，并按照合同的约定支付临时使用土地补偿费。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法》第五十七条
建设项目施工和地质勘查需要临时使用国有土地或者农民集体所有的土地的，由县级以上自然资源主管部门批准。
