摩托车协议过户被交警查是会被扣的。
摩托车协议过户会不会被交警扣车与以下几种情况有关：
1.摩托车驾驶人有没有携带驾驶证
2.有没有缴纳机动车交强险
3.有没有盗抢嫌疑
4.是不是拼装车和有没有达到报废标准等有关。
就一般来说，协议过户的摩托车是因为买卖双方无法变更摩托车驾驶证、牌照和登记证书等信息，从而涉嫌违反道路交通安全法，被交警查住后会被扣留。
一些人为了省事和便宜，从网上或者二手车买卖渠道购买了摩托车，这种摩托车并没有在当地交管所或者异地交管所办理二手车转让过户手续，只是买卖双方签订了过户手续，看似合理，实则不合法。一旦驾驶这样的摩托车上路的话，只要被交警查到，是很容易被扣车的。
一般来说，摩托车如果是协议过户的话，交强险是需要摩托车所有人到当地车管所缴纳的，如果买主能找到卖主，由卖主办理相关手续，不会影响年审，但是如果联系不到卖主将无法过年审，骑着这样的摩托车上路，是会被交警扣车和罚款的。
法律依据《中华人民共和国民法典》
第一千二百一十条 当事人之间已经以买卖或者其他方式转让并交付机动车但是未办理登记，发生交通事故造成损害，属于该机动车一方责任的，由受让人承担赔偿责任。
《二手车流通管理办法》
第十九条 二手车交易完成后，卖方应当及时向买方交付车辆、号牌及车辆法定证明、凭证。车辆法定证明、凭证主要包括：
（一）《机动车登记证书》；
（二）《机动车行驶证》；
（三）有效的机动车安全技术检验合格标志；
（四）车辆购置税完税证明；
（五）养路费缴付凭证；
（六）车船使用税缴付凭证；
（七）车辆保险单。
