1. 避免将所有文件存放在根目录
将所有文件都存放在根目录下会导致管理混乱，影响工作效率，同时也会减慢上传速度。因此，建议尽可能减少根目录下的文件存放数量。
2. 按栏目内容建立子目录
应根据主菜单栏目内容建立子目录。例如，网页教程类站点可以根据技术类别分别建立相应的目录，如Flash、Dhtml、Javascript等；企业站点可以按公司简介、产品介绍、价格、在线定单、反馈联系等建立相应目录。
3. 建立独立的子目录
对于需要经常更新的内容，如what's new、友情连接等，应建立独立的子目录。而一些相关性强、不需要经常更新的栏目，如关于本站、关于站长、站点经历等，可以合并放在一个统一目录下。
4. 特定目录存放程序和下载内容
所有程序一般都存放在特定目录，例如：CGI程序放在cgi-bin目录，以便于维护管理。所有需要下载的内容也最好放在一个目录下。
5. 为每个主目录建立独立的images目录
在每个主目录下都建立独立的images目录，以方便管理。根目录下的images目录仅用于存放首页和一些次要栏目的图片。
6. 控制目录的层次
目录的层次建议不要超过3层，以方便维护管理。
7. 注意目录命名规范
避免使用中文目录，以免对网址的正确显示造成困难。同时，不要使用过长的目录名，以免不便于记忆。
8. 使用意义明确的目录名
尽量使用意义明确的目录名，以便于记忆和管理。例如，可以用Flash、Dhtml、Javascript来建立目录，而不是使用1、2、3等。
