有鱼的池塘消毒工作主要针对鱼群，确保它们健康生活。常用的消毒方法包括：
第一种是硫酸铜溶液消毒，每100公斤水中加入0.8克硫酸铜，充分搅拌溶解后制成消毒液。将鱼种放入溶液中，根据水温的不同，浸洗时间有所变化：10~15℃时需20~30分钟，15~20℃时则为15~20分钟。这种方法能有效防治多种鱼病，如细菌性烂鳃病、赤皮病、隐鞭虫、口丝虫、车轮虫、斜管虫、毛管虫等。
第二种是漂白粉溶液消毒，每100公斤水中加入1克漂白粉，搅拌均匀后制成消毒液。同样根据水温不同，浸洗时间有所调整：10~15℃时为20~30分钟，15~20℃时为15~20分钟。这种消毒方法对隐鞭虫、口丝虫、毛管虫、斜管虫、车轮虫等病有显著效果。
第三种是高锰酸钾溶液消毒，每100公斤水中加入2克高锰酸钾，搅拌溶解制成消毒液。浸洗时间依据水温调整：10~20℃时为20~30分钟，20~25℃时为15~20分钟。此方法能有效防治三代虫、指环虫、车轮虫、斜管虫等疾病。若浸洗时间延长至2~2.5小时，还能进一步防治锚头鳋、烂鳃病等。
第四种是敌百虫溶液消毒，每20~25公斤水中加入50克90%敌百虫晶体，搅拌均匀后制成消毒液。将鱼种放入溶液中浸洗5~15分钟，可有效防治烂鳃病、赤皮病、胸炎以及其他多种寄生虫病。
最后一种是食盐水消毒，每100公斤水中加入3~4公斤食盐，充分搅拌均匀制成消毒液。将鱼种缓缓放入溶液中，浸洗5~6分钟，能有效防治水霉病、赤皮病、口丝虫、毛管虫等疾病。
