金税盘和税控盘在功能和适用范围上有显著区别。金税盘主要用于增值税防伪税控系统，能够开具增值税专用发票和增值税普通发票，适用于增值税一般纳税人，但不包括提供货物运输服务的纳税人。相比之下，税控盘则专门用于货物运输业专用发票税控系统，能够开具货物运输业增值税专用发票和机动车销售统一发票，主要服务于提供货物运输服务的一般纳税人。
为了应对两套税控器具并存带来的不便，以及降低企业纳税成本，国家税务总局自2013年10月开始着手研究将增值税防伪税控系统与货物运输业专用发票税控系统进行融合开发。这不仅提升了税控装置的底层技术，还升级了金税盘和税控盘，保持了它们各自的密钥体系，以灵活适应用户需求。同时，税控开票软件也进行了相应修改，使得防伪税控系统和货物运输税控系统都能开具增值税专用发票、增值税普通发票、货物运输业增值税专用发票和机动车销售统一发票。
此外，税控系统后台也进行了相应的调整，包括增加税控装置读写访问控件，支持金税盘和税控盘的发行，以及支持单营户、混营户的自动读写功能。抄报接口也得到了升级，能够统一接收四种发票的抄报信息。为了确保安全性，扫描识别控件也进行了改进，以支持认证不同税控装置及密钥体系开具的四种发票。同时，增值税发票网上受理平台也进行了相应修改，规范了四种发票的加密方式和报文格式，增强了安全性。
在实际应用中，金税盘和税控盘的功能互通已经得到了初步验证。从5月中下旬开始，国家税务总局已在浙江、湖南、宁波、北京、安徽等地组织了税控系统功能互通项目的业务技术实地测试。通过测试，基层业务和技术人员反映的问题和缺陷得到了修正和验证，软件功能得到了进一步优化。
未来，国家税务总局将继续根据业务需求，将货运发票红字票和失控货运发票纳入统一管理，并修改和完善货运发票后台系统。同时，还将整合两个税控系统的后台软件，统一税务端界面，实现单点登录，进一步方便基层操作，为营改增的持续推进和增值税发票系统升级版的推行做好准备。
