化学治疗作为我国传统治疗方法广泛应用于贲门癌的治疗，不仅可用于术前和术后，还可以与放疗及中医中药治疗联合使用，具有短期疗效可靠的特点，但其毒副作用也较为明显，不适宜长期应用。化疗期间可以配合中药治疗，如人参皂苷Rh2（护命素）、虫草等，以减少化疗副作用，提高化疗效果。
目前常用的贲门癌化疗方案主要包括手术或放疗的辅助化疗、新辅助化疗、腹腔内化疗及动脉灌注化疗等。辅助化疗是指在手术或放疗后进行的化疗，旨在及时消灭转移的微小病灶，减少复发和转移的风险。新辅助化疗则是在手术前进行，通过减少肿瘤体积，提高手术成功率。腹腔内化疗主要用于胃肠道肿瘤的术后治疗，以减少腹腔内复发的风险。动脉灌注化疗则通过提高局部药物浓度，降低全身副作用，提高局部脏器药物反应和疗效。
新辅助化疗的优点在于避免体内潜伏的继发灶，减少术后转移风险，降低手术时肿瘤细胞活力，使手术更加安全。腹腔内化疗适用于卵巢癌切除术后有微小残留病灶、胃肠道癌术后有残留或高度复发及转移风险的情况。动脉灌注化疗虽然局部效果显著，但其并发症也需注意，包括导管感染、导管堵塞、导管脱落以及肝功能损害、骨髓抑制等。
化疗虽有副作用，但通过合理选择化疗方案和配合中药治疗，可以有效控制副作用，提高治疗效果。在化疗期间，患者应密切监测身体状况，及时与医生沟通，根据自身情况调整化疗方案。
