选择嫁接苗还是自根苗，取决于当地的自然条件，包括最低温度和是否有根瘤蚜等特殊病虫害。葡萄扦插繁殖简便，自根苗一直是主要繁殖方式，然而上个世纪，美洲葡萄的引入带来了根瘤蚜的问题。欧亚种葡萄虽然品质上乘，但普遍缺乏对根瘤蚜的抵抗力，这几乎摧毁了欧洲的葡萄产业。具有美洲葡萄亲缘的品种对根瘤蚜有较强的抵抗力，因此嫁接苗应运而生。
在中国，由于北方冬季寒冷，需要埋土防寒，这大大限制了根瘤蚜的发生。然而，北方的寒冷天气也会导致葡萄自根苗遭受冻害。因此，人们利用野生山葡萄对葡萄进行嫁接，有效解决了自根苗冬季冻害的问题。
砧木的使用可以解决生产中遇到的问题，但也可能带来一些不良影响。例如，使用贝达嫁接葡萄会导致品质下降，果粒变小。南方地区多阴雨，光照不足，导致欧亚种葡萄生长势弱，易患霜霉病。因此，人们多选用巨峰和藤稔葡萄作为砧木来改善生长条件，但这些砧木自身易裂果，这也会影响到接穗。
自根苗通常品质较好，但抗性较弱。在生长速度方面，这取决于所用砧木，使用巨峰砧木的葡萄比使用SO4砧木的葡萄生长得更快，因为SO4多表现为小脚，而巨峰多为大脚。在结果速度方面，两者差别不大，因为葡萄通常在两年后见果，三年后丰产。关于产量，没有具体数据，但从理论上讲，自根砧苗可能会更高一些。对于寿命来说，由于时间过长没有具体观察，推断嫁接苗可能会更长一些。
