二审程序中的全面审查原则表明，第二审人民法院在审理案件时，不仅限于一审判决中被上诉或抗诉的部分，而是应当对一审判决认定的事实和适用法律进行全面、深入的审查。这种全面审查的原则旨在确保司法公正，避免因一审程序中的疏忽或错误而影响案件的最终判决。
具体而言，第二审人民法院在审理过程中，需要仔细审查一审法院的证据采信、事实认定、法律适用等各个方面。如果在二审庭审中发现一审法院存在程序违法的情况，如审理过程中违反了法定程序，或者在证据采信、事实认定等方面存在明显错误，二审法院应当首先指出这些违法或错误，并依法进行纠正。
然而，这并不意味着二审法院必须在发现程序违法的情况下，直接对实体问题进行审理。在某些情况下，程序违法可能对案件事实认定和法律适用产生重大影响，此时，二审法院应当首先纠正程序违法，然后再进行实体问题的审理。但在其他情况下，如程序违法对案件事实认定和法律适用影响不大，二审法院可以先纠正程序违法，待程序合法后再进行实体问题的审理。
综上所述，二审法院在发现一审法院程序违法的情况下，应当首先纠正程序违法，然后再决定是否对实体问题进行审理。这种做法不仅有助于确保司法公正，也有利于提高司法效率，避免不必要的重复审理。
此外，全面审查原则还要求二审法院在审理过程中，应当充分考虑上诉人的上诉请求和抗诉人的抗诉理由，以及双方当事人在庭审中的陈述和辩论，确保审理过程的公正性和透明性。
