若工程挂靠协议被判定为无效，且竣工验收合格的情况下，发包方需依照合同约定支付工程款项；
反之，若未通过竣工验收且经修复仍不达标，承包方可诉求工程款折价补偿。
相关规定体现在《中华人民共和国民法典》第七百九十三条：
建设工程施工合同无效，但若建设工程验收合格，可参照合同中工程价款的约定进行折价补偿；
若验收不合格，则根据以下两种情况处理：
（1）修复后验收合格，发包方有权要求承包方承担修复费用；
（2）修复后仍不合格，承包方无权请求工程款折价补偿。
此外，若发包方对建设工程不合格所导致的损失存在过失，应承担相应责任。
