在32位系统中，安装的软件通常会被存放在Program Files（X86）目录下，这是因为32位软件无法直接访问64位的程序文件夹，故而系统为32位软件提供了一个特殊的目录来存放它们。与此相反，在64位系统中，软件通常会被存放在Program Files目录下，这里包含了64位的软件和程序。
具体来说，在32位系统中安装的软件，无论是32位还是64位兼容的软件，都会被安装到Program Files（X86）目录下。而在64位系统中，32位软件则会被安装到Program Files（X86）目录下，而64位软件则会安装到Program Files目录下。因此，在64位系统中，如果需要安装32位的软件，可以选择Program Files（X86）目录，如果是安装64位的软件，可以直接安装到Program Files目录。
值得注意的是，Program Files（X86）目录下的Internet Explorer（IE）是32位版本的，而Program Files目录下的IE浏览器则是64位版本的。这种设置有助于用户根据自身需要选择合适的IE版本，同时也避免了不同版本的IE之间可能产生的冲突。
另外，用户也可以根据自己的需求，将软件安装到指定目录中，这样可以更方便地管理和使用这些软件。如果不确定应该安装到哪个目录，可以参考软件安装向导的提示，或者咨询软件的技术支持。
综上所述，Program Files和Program Files（X86）目录之间的主要区别在于它们分别用于存放64位和32位软件。用户可以根据软件的类型和自己的需求，选择合适的目录进行安装。
