在液相色谱分析过程中，流动相的选择和处理对分析结果至关重要。确保流动相的纯净是避免柱塞、密封环、缸体和单向阀损坏的关键。使用Millipore滤膜或砂滤棒等过滤装置可以有效去除流动相中的微粒杂质。流动相的处理通常包括蒸馏和过滤，以确保其纯净度。
此外，泵的维护也十分关键。使用后应及时清洗泵，避免流动相中的腐蚀性物质和缓冲液导致泵内固体微粒的析出，进而损坏泵的内部组件。停泵时，应使用纯水清洗泵，再换成适合色谱柱保存和泵维护的溶剂。
若流动相走空，泵将无法正常工作，这不仅会导致柱塞、缸体或密封环磨损，还会引起漏液。若出现压力和流量不稳定的情况，首先应检查泵内是否有大量气体，通过泄压和抽气的方式排除气泡。若单向阀内有异物，需卸下并用丙酮超声清洗。此外，砂滤棒内可能有气泡或被堵塞，需用流动相除气泡，或用稀酸处理以清除微生物。
在进行梯度洗脱时，由于溶剂浓度不断变化，可能会导致基线漂移。梯度洗脱的优点在于缩短分析周期、提高分离能力、改善峰型，但同时也会产生基线漂移的问题。因此，在梯度洗脱过程中，需要特别注意溶剂的选择和控制，确保溶剂的混合和配比符合要求，以减少基线漂移的影响。
管路堵塞或泄漏也是影响液相色谱分析的重要因素。在检查堵塞或泄漏时，应逐段进行，以确保准确找到问题所在。通过定期清洗和维护，可以有效避免这些问题，提高液相色谱分析的准确性和稳定性。
