水性美缝剂和油性美缝剂各有其优势和不足，选择哪种更好取决于个人的需求和偏好。可以从原料差异、施工环境、硬度、清洗难度、环境保护程度来看。
1、原料差异。水性美缝剂：水分子作为分散介质，在固化前能被水分解，所添加的原料属天然材料，是一种对环境无毒、无害、环保的高分子聚合物。油性美缝剂：以环氧树脂为主要原料，在表面成膜，固化前不会被水分解，添加有化学物质的助稳性，对环境有一定影响。
2、施工环境不同。水性美缝剂：施工环境需保持完全干燥，不能留下任何水渍或湿气，否则美缝剂易出现干裂、鼓胀、发白等现象。油性美缝剂：施工环境不可见明水，环境稍湿不影响施工，所以长期潮湿卫生明显更适合使用油性美缝剂。
3、硬度不同。水性美缝剂：水性美缝剂固化后非常坚韧，有一定的韧性，能满足瓷砖热胀冷缩，适合铺设地暖的家庭使用。油性美缝剂：油性美缝剂固化后很硬，但韧性不够，其硬度可与瓷砖媲美，但不具韧性，适用于较宽的瓷砖缝。
4、清洗难度不同。水性美缝剂：水性美缝剂如果无意间粘在手上，可以在固化前用清水洗掉，但是在固化后要用酒精、醋、清洁剂清洗。油性美缝剂：油性美缝剂无论是否固化，都需要用酒精、醋等清洁剂清洗，而且很难清洁，清洁后还会留下痕迹。
5、环境保护程度不同。水性美缝剂：采用天然可溶于水的材料，对环境无害，可用于各种空间，施工无气味无有害物质。油性美缝剂：不溶于水，添加有化学物质，受成分影响，环保性能不如水性美缝剂，带有刺鼻的气味。
