包括位置不同、作用不同、结构不同、损伤的表现不同等。
1、位置不同。指深屈肌腱位于指深屈肌和指浅屈肌之间，是由比目鱼肌和腓肠肌的肌腱在手指的掌侧面形成。指浅屈肌腱位于指浅屈肌和指深屈肌之间，是由比目鱼肌和腓肠肌的肌腱在手指的背侧面形成。
2、作用不同。指深屈肌腱可以使手指产生较大的活动度，也可以使手指的关节更加灵活。指浅屈肌腱可以使手指产生较小的活动度，也可以使手指的关节更加灵活。
3、结构不同。指深屈肌腱主要是由比目鱼肌和腓肠肌的肌腱在手指的掌侧面形成。指浅屈肌腱主要是由比目鱼肌和腓肠肌的肌腱在手指的背侧面形成。
4、损伤的表现不同。指深屈肌腱损伤后，手指的指深屈肌会出现明显的收缩，手指会出现内收、外展、背伸等活动障碍。指浅屈肌腱损伤后，手指的指浅屈肌会出现明显的收缩，手指会出现内收、外展、背伸等活动障碍。
