经济形态不同、社会分工不同、生产目的不同、历史结果不同。
1、经济形态不同。自然经济是一种自给自足的经济形式，目的是满足本经济单位或生产者个人的需要，而不是为了交换。商品经济则是以交换为目的的经济活动，其生产不仅为了满足生产者自己的需求，也为了满足社会的其他需求。
2、社会分工不同。在自然经济条件下，社会分工不发达，生产规模相对较小，劳动生产率和社会生产力发展缓慢。相比之下，商品经济建立在社会分工的基础上，生产规模更大，劳动生产率和社会生产力发展迅速。
3、生产目的不同。自然经济以简单再生产为特征，主要关注满足基本生活需求。而商品经济不仅有简单再生产，更重要的是它包含了扩大再生产的过程，即不仅满足当前需求，还追求通过交换实现资本和规模的扩张。
4、历史结果不同。随着社会生产力和商品货币关系的发展，自然经济逐渐瓦解，往往被资本主义商品经济所取代。商品经济的发展被视为人类社会生产发展的一个必经阶段。
