深圳共有产权住房的申请流程如下：
1、在政府网站或者信息平台发布共有产权住房配售通告。
2、申请人按照配售通告的要求，提交认购申请，并签署诚信申报声明。
3、主管部门按照配售通告确定的规则组织资格审核，审核结果由主管部门在政府网站或者信息平台公示五个工作日，公示期满无异议或者异议不成立的，确定合格申请人名单。
4、主管部门按照配售通告确定的规则，采取轮候、抽签、摇号、综合评分等方式确定选房排序并组织选房。
5、选定住房后，申请人及共同申请人应当在规定时间内办理认购手续，签订买卖合同。
6、开发建设单位办理共有产权住房初始登记后，协助住房保障实施机构、购买共有产权住房的申请人及共同申请人办理不动产登记。
