不会全部被扣除的；
(一)、职工患病休假在6个月内：
(1)连续工龄病假日工资按职工日平均工资的60%计发;
(2)连续工龄≥2年且
(3)连续工龄≥4年且
(4)连续工龄≥6年且
(5)连续工龄≥8年者，病假日工资按职工日平均工资的100%计发。
(二)、职工患病休假在六6个月以上：
(1)连续工龄
(2)连续工龄≥1年且
(3)连续工龄≥3年者，病假期间工资按职工月工资收入的60%计发。
2、疾病救济费：患病停工6个月以上的职工，如领取疾病救济费低于本企业职工月平均工资40%者，应按40%的标准计发，但不能高于该职工月工资。
(1)连续工龄
(2)连续工龄≥1年且
(3)连续工龄≥3年者，疾病救济费按职工月工资收入的60%计发。
一、劳动能力鉴定
1、申请劳动能力鉴定的条件：
(1)职工非因工致残和经医生或医疗机构认定患有难以治疗的疾病，在医疗期内医疗终结，不能从事原工作，也不能从事用人单位另行安排的工作的;
(2)企业职工非因工致残和经医生或医疗机构认定患有难以治疗的疾病，医疗期满。
2、伤残待遇：
(1)被鉴定为一至四级的，应当退出劳动岗位，终止劳动关系，办理退休、退职手续，享受退休、退职待遇;
(2)被鉴定为五至十级的，医疗期内不得解除劳动合同。
二、经济补偿金
医疗期满尚未痊愈被用人单位解除劳动合同的，用人单位应支付经济补偿和医疗补助费。标准为：劳动者在本单位工作每满一年，支付相当于1个月工资的经济补偿金，同时还应支付不低于6个月工资的医疗补助费。患重病和绝症的还应当增加医疗补助费，患重病的增加部分不低于医疗补助费的50%，患绝症的增加部分不低于医疗补助费的100%
