在名侦探柯南的故事中，怪盗基德与少年侦探团的互动频繁而有趣。他们之间的对决和合作贯穿了整个系列。例如，在第076集中，柯南与怪盗基德展开了激烈的较量，这次对决中，怪盗基德甚至易容成了毛利兰。在第132集《魔术爱好者杀人事件》中，怪盗基德再次登场，这一次他易容成了土井塔克树，事件篇、疑惑篇和解决篇分别讲述了这一系列的谜团。到了第219集，怪盗基德与工藤新一再度相遇，这次是通过易容毛利小五郎来展开对决。
在第356集中，怪盗基德展示了他惊人的空中步行技巧，这次他易容成了铃木次郎吉。而第395集《奇异屋宇的大冒险》中，怪盗基德则易容成了一位老婆婆，机关篇和解决篇分别讲述了这一冒险的起因和最终真相。在第469集《怪盗基德与四幅名画》的前篇中，怪盗基德易容成高木警官，而在后篇中，这一易容再次出现，同时还出现了怪盗基德自身的身影。
在第472集中，柯南回忆起少年时的冒险，这次他易容成了黑羽盗一，这个情节不仅展现了柯南的童年，还出现了7岁的快斗。而在第479集《和服部平次一起的三天》中，柯南与服部平次一起度过三天，这一集不仅充满了冒险，还让读者见证了两位侦探的合作与友谊。
怪盗基德与四幅名画的对决在第470集中展开，这次他再次易容成高木警官。而在第515集《怪盗基德瞬间移动》中，怪盗基德展现了他不可思议的瞬间移动能力。到了第537集，《怪盗基德VS最强金库》的前篇中，怪盗基德易容成女仆濑户，而在后篇中，这一易容再次出现，同时还出现了怪盗基德自身。
通过这些情节，怪盗基德与少年侦探团之间的故事变得愈发精彩，展现了柯南系列中侦探与反派之间的智慧较量。
