海南大学，海南师范大学，海南医学院，海南热带海洋学院。
1、海南大学：海南大学是海南地区最好实力最强的大学。海南大学的历史可以追溯到1958年创建的华南热带农业大学，1983年组建原海南大学，2007年合并为新的海南大学。学校王牌专业有法学、思想政治教育、汉语言文学、生物科学、生物技术、通信工程、化学工程与工艺、食品科学与工程、农学、园艺等。
2、海南师范大学：海南师范大学是海南省属重点大学，是教育部与海南省共建高校。学校开设67个本科专业，18个一级学科硕士授权点，5个一级学科博士授权点，2个博士后可以流动站。学校特色专业有小学教育、汉语言文学、英语、新闻学、化学、生物科学、思想政治教育、教育学、体育教育、历史学等。
3、海南医学院：海南医学院是海南自贸区内唯一一所公办医学院，学校开设30个本科专业，一级学科博士点1个，一级学科硕士点5个。1993正式更名为海南医学院。学校开设特色专业有临床医学、药学、护理学、医学检验技术、预防医学、医学影像学、生物技术、中西医临床医学、中医学、中药学等。
4、海南热带海洋学院：海南热带海洋学院是国家海洋局、中国海油集团、海南省、三亚市和三沙市共建公办高校，由中国海洋大学对口支援。学校开设本科专业55个，一级学科硕士授予点2个。2015年更名为如今的校名，2018年海南省海洋与渔业科学院并入该校。学校特色专业有旅游管理、海洋技术、环境工程、生态学、食品科学与工程、社会工作、休闲体育、水产养殖学、海洋科学、网络工程、园艺等。
