
在生物信息学数据分析领域,上传测序数据至服务器通常通过FTP软件或scp命令实现。然而,这些方法在速度和便捷性上存在局限性。使用scp命令进行文件传输时,代码繁琐,传输速度慢,以50TB的raw fastq文件为例,以1MB/s的速度传输,预计需要606天。另外,每次传输都需要在终端中选择服务器或本地目录,并再次验证登录信息,显得操作繁琐。
在此背景下,Jimmy老师推荐了一款名为“奶牛快传”的工具,用以解决FTP和scp命令的限制。它提供了一种更快速、更便捷的文件交互方式。首先,访问GitHub下载Linux版本的奶牛快传。
使用奶牛快传的操作非常简单。为方便调用,可以将它软链接到bin目录,或者通过全路径调用。添加到bin目录或激活环境变量并非必需,但可以简化操作流程。
上传文件时,可以通过命令行直接执行,速度显著提升。以6MB/s的速度上传文件,相较于原先600天的时间,现在仅需100天即可完成。上传后,奶牛快传会生成一个下载码,用户可以通过cowtransfer.com/s/链接下载文件。
此外,奶牛快传还支持结合云盘功能使用,但非会员单次传输上限为2GB。对于大文件传输,用户可选择升级会员或继续使用scp命令。注册并登陆奶牛快传官网,可享受10GB的免费云盘容量。上传文件后,可将其保存至云盘或直接下载。
然而,奶牛快传的界面有时可能包含一些广告和宣传信息,用户需注意区分。尽管如此,创始人提出的一条格言为这一工具增添了一份独特的价值。