微生物分类知识

    微生物（Microorganism, microbe）一词并非生物分类学上的专门名词，而是指大量的、极其多样的、不借助显微镜看不见的微小生物类群的总称。因此，微生物通常包括病毒、细菌、真菌、原生动物和某些藻类，它们的大小和特征见表1-1。 

表1-1.微生物形态、大小和细胞类型 

微生物    大小近似值     细胞特征 

病毒    0.01～0.25μm    非细胞的 

细菌      0.1～10μm     原核生物 

真菌        2μm～1m     真核生物 

原生动物   2～1000μm    真核生物 

藻类       1μm～几米    真核生物 

    但是有些例外。如许多真菌子实体、蘑菇等常肉眼可见；相同的，某些藻类能生长几米长。一般来说，微生物可以认为是相当简单的生物，大多数的细菌、原生动物、某些藻类和真菌是单细胞的微生物，即使为多细胞的微生物，也没有许多的细胞类型。病毒甚至没有细胞，只有蛋白质外壳包围着的遗传物质，且不能生活。 

1.2 微生物在生物分类中的地位 

    在生物发展的历史上，曾把所有的生物分为动物界和植物界两大类。而微生物，不仅形体微小、结构简单，而且它们中间有些类型像动物，有些类型像植物，还有些类型既有动物的某些特征，又具有植物的某些特征，因而归于动物或植物都不合适。于是，1866年海克尔（Haeckel）提出区别动物界与植物界的第三界——原生生物界。它包括藻类、原生动物、真菌和细菌。 

    随着科学的发展，新技术和研究方法的应用，尤其是电子显微镜和超显微结构研究技术的应用，发现了生物的细胞核有两种类型，一种是没有真正的核结构，称为原核，其细胞不具核膜，只有一团裸露的核物质；另一种是由核膜、核仁及染色体组成的真正的核结构称为真核。动物界、植物界及原生生物界中的大部分藻类、原生动物和真菌是真核生物，而细菌、蓝细菌则是原核生物。真核生物和原核生物不仅细胞核的结构不同，而且其性状也有差别，真核生物和原核生物性状的比较内容将在第二章详细介绍。 

    根据核结构的不同，1969年魏塔科（Whittaker）提出五界系统，即动物界、植物界、原生生物界、真菌界和原核生物界。五界系统的生物都有细胞结构。病毒作为一界被提出的较晚，主要原因是 ①病毒和类病毒是生物还是非生物，是原始类型还是次生类型是长期争论未决的问题；②病毒不是用双命法，分类不用阶元系统。但经过长期研究发现，病毒和细胞型生物是有共同特性：①遗传物质是DNA（部分病毒是RNA）；②使用共同的遗传密码。在此基础上，我国学者于1979年提出将无细胞结构病毒立为病毒界，从而建立了六界系统。 

细胞型生物 

动物界（Animalia） 

植物界（Plantae） 

原生生物界（Protista）：原生动物、大部分藻类及粘菌 

真菌界（Fungi）：酵母、霉菌 

原核生物界（Procaryotae）：细菌、放线菌、蓝细菌等 

非细胞型生物：病毒界（Vira） 

录入时间:2012-8-14 8:38:03 来源：原创

  原核界特点：单细胞及集合/基因组无膜包裹/二等增殖无减数分离/无膜隔细胞器/无细胞质流现象/为70S核糖体/壁含肽聚糖等

  真核分类系统纲要

真菌界特点为分解吸收式营养/具独特发达菌丝体和子实体/壁含几丁质成分/胞质无叶绿体线粒简 / 粗内质网松散/组织化程度低/核方式简

一、原核微生物伯杰氏分类系统：《伯杰氏细菌鉴定手册》、《伯杰氏系统细菌学手册》

古生菌域中三界与代表属

 古生菌域中三界为：古古生菌界、泉古生菌界、广古生菌界

微生物的分类系统

录入时间:2006-10-19 14:57:39 来源：其它

    这里仅简述原核微生物和真核微生物的分纲体系。

    1  原核生物界（Procaryotae）

  （1） 光能营养原核生物门

     Ⅰ 蓝绿光合细菌纲（蓝细菌类）

     Ⅱ 红色光合细菌纲

     Ⅲ 绿色光合细菌纲

  （2）化能营养原核生物门

     Ⅰ  细菌纲

     Ⅱ 立克次氏体纲

     Ⅲ  柔膜体纲

     Ⅳ  古细菌纲

    2  真核微生物（Eucaryotic microbes）

    真核策生物主要包括各类真菌，还有粘菌等。

    真菌划分各能分类单位的基本原则是以形态特征为主，生理生化、细胞化学和生态等特征为辅。丝状真菌主要根据其孢子产生的方法和孢子本身的特征，以及培养特征来划分各级的分类单位。一些病原真菌的鉴定，寄生和症状也可作为参考依据。真菌可分以下四纲：

    Ⅰ 藻状菌纲　菌丝体无分隔，含多个核。有性繁殖形成卵孢子或接合孢子。

    Ⅱ 子囊菌纲　菌丝体有分隔，有性阶段形成子囊孢子。

    Ⅲ 担子菌纲　菌丝体有分隔，有性阶段形成担孢子。

    Ⅳ 半知菌纲　包括一切只发现无性世代未发现有性阶段的真菌。

    粘菌也可分为四纲，即

    Ⅰ 网粘菌纲　自细胞两端各自伸出长的粘丝并接连形成粘质的网络——假原质团。

    Ⅱ 集胞粘菌纲　分泌集胞粘菌素，形成假原质团。

    Ⅲ 粘菌纲　形成原质团，腐生性自由生活。

    Ⅳ 根肿病菌纲　形成原质团，专性寄生。亦有将之归于真菌类。

微生物的分类依据

录入时间:2006-10-19 14:55:17 来源：其它

    1. 形态特征

  （１）个体形态　镜检细胞形状、大小、排列，革兰氏染色反应，运动性，鞭毛位置、数目，芽孢有无、形状和部位，荚膜，细胞内含物；放线菌和真菌的菌丝结构，孢子丝、孢子囊或孢子穗的形状和结构，孢子的形状、大小、颜色及表面特征等。

  （２）培养特征

   １）在固体培养基平板上的菌落（colony）和斜面上的菌苔（lawn）性状（形状、光泽、透明度、颜色、质地等）；

   ２）在半固体培养基中穿刺接种培养的生长情况；

   ３）在液体培养基中混浊程度，液面有无菌膜、菌环，管底有无絮状沉淀，培养液颜色 等。

    2.生理生化特征

 （１）能量代谢　利用光能还是化学能；

 （２）对Ｏ2的要求　专性好氧、微需氧、兼性厌氧及专性厌氧等；

 （２）营养和代谢特性　所需碳源、氮源的种类，有无特殊营养需要，存在的酶的种类等。

    3.生态习性

    生长温度，酸碱度，嗜盐性，致病性，寄生、共生关系等。

    4.血清学反应

    用已知菌种、型或菌株制成抗血清，然后根据它们与待鉴定微生物是否发生特异性的血清学反应，来确定未知菌种、型或菌株。

    5  噬菌反应

　  菌体的寄生有专一性，在有敏感菌的平板上产生噬菌斑，斑的形状和大小可作为鉴定的依据；在液体培养中，噬菌体的侵染液由混浊变为澄清。噬菌体寄生的专业性有差别，寄生范围广的谓多价噬菌体，能侵染同一属的多种细菌；单价噬菌体只侵染同一种的细菌；极端专业化的噬菌体甚至只对同一种菌的某一菌株有侵染力，故可寻找适当专化的噬菌体作为鉴定各种细菌的生物试剂。

   6  细胞壁成分

   革兰氏阳性细菌的细胞壁含肽聚糖多，脂类少。革兰阴性细菌与之相反。链霉菌属（Streptomyces）的细胞壁含丙氨酸、谷氨酸、甘氨酸和２，６-氨基庚二酸，而含有阿拉伯糖是诺卡氏菌属（Nocardia）的特征。霉菌细胞壁则主要含几丁质。

    7  红外吸收光谱

    利用红外吸收谱技术测定微生物细胞的化学成分，了解微生物的化学性质，作为分类依据之一。

    8  ＧＣ含量

    生物遗传的物质基础是核酸，核酸组成上的异同反映生物之间的亲缘关系。就一种生物的ＤＮＡ来说，它的碱基排列顺序是固定的。测定四种碱基中鸟嘌呤（Ｇ）和胞密啶（Ｃ）所占的摩尔百分比，就可了解各种微生物ＤＮＡ分子不同源性程度。亲缘关系接近的微生物，它们的Ｇ＋Ｇ含量相同或近似的两种微生物，不一定紧密相关，因为它们的ＤＮＡ的四个碱基的排列顺序不一定相同。

    9  ＤＮＡ杂合率

    要判断微生物之间的亲缘关系，须比较它们的ＤＮＡ的碱基顺序，最常用的方法是ＤＮＡ杂合法。其基本原理是ＤＮＡ解链的可逆性和碱基配对的专一性。提取ＤＮＡ并使之解链，再使互补的碱基重新配对结合成双链。根据能生成双链的情况，可测知杂合率。杂合率越高，表示两个ＤＮＡ之间碱基顺序的相似越高，它们间的亲缘关系也就越近。

    10  核糖体核糖酸（rＲNA ）相关度

    在ＤＮＡ相关度低的菌株之间，rRNA同源性能显示它们的亲缘关系。Rrna-DNA分子杂交试验可没定Rrna的相关度，揭示Rrna 的同源性。

    11  rRNA的碱基顺序

    ＲＮＡ的碱基顺序由ＤＮＡ转录来的，故完全具有相对应的关系。提取并分离细菌内标记的１６SrRNA,以核糖核酸消化，可获得各种寡核苷酸，测定这些寡核苷酸上的碱基顺序，可作为细菌分类学的一种标记。

    12  核糖体蛋白的组成分析

    分离被测细菌的３０Ｓ和５０Ｓ核糖体蛋白亚单位，比较其中所含核糖体蛋白的种类及其含量，可将被鉴定的菌株分为若干类群，并绘制系统发生图。

    13  其它

    如脂类分析、核磁共振（NMR）谱、细胞色素类型以及辅酶Ｑ的种类（所含异间二烯侧链的长度）等。

微生物的分类单位与命名

录入时间:2006-10-19 14:48:57 来源：其它

    门：真菌门 Eumycophyta

    纲：子囊菌纲 Ascomyeetes 

    亚纲：原子囊菌亚纲 Protoascomycetes

    目：内孢霉目Endomyctales  

    科：内孢霉科Endomycetaceae 

    亚科：酵母亚科Sacchromycetoideae 

    属：酵母属Sacchromyces 

    种：酿酒酵母S.cerevisiae Hansen

    微生物的命名，与其他生物一样，采用国际上通用的双名法，学名通常由一个属名加一个种的加词构成。出现在分类学文献中的学名，往往还加上首次定名人（外加括号）、现名定人和现名定名年份，但在一般使用时，这几个部分总是省略的。

    例如，由Ehrenberg于1838年定名为Vibrio subtilis（枯草弧菌）的细菌，到1872年，Cohn发现弧状不是该菌的特征，它的特征是杆状具芽孢，故将它转到芽孢杆菌属，称为枯草芽孢杆菌（简称枯草杆菌），其学名为Bacillus subtilis(Ehrenberg)Cohn1872。再如，可使许多科的植物生肿瘤的土壤杆菌属细菌称为根癌土壤菌，学名为Agrobacterium tumefaciens(Smith&Townsend)Conn1972;寄居于温血动物肠道下部的埃希氏菌属细菌称为大肠埃希氏菌（简称大肠杆菌），其学名为Excherichia coli(Migula) Castellani&Chalmers1919；葡萄球菌属呈金黄色葡萄球菌，学名为Staphylococcus aureus Rosenbach1884；呈铜绿色的假单胞菌（即绿脓杆菌）学名为 Pseusomonas aeruginosa(Schroeter)Migula1920。

    有时，从自然界分离到的某一微生物纯种，与典型的特征不完全符合，而不相符的这一特性又是稳定的，则将这种微生物称为典型种的变种（variety，简称var）。在实验室里获得的变异型则称为亚种(subspecies，简称subsp)。

变种或亚种的学名按“三名法”构成。

    例如，有一种芽孢杆菌，能产生黑色素，其余特征与典型的枯草杆菌完全符合，该菌学名为Bacillus substilis var.niger（枯草芽孢杆菌黑色变种）。

同种不同来源的微生物纯培养，称为菌株（strain）。菌株的名称都放在学名（即属名和种的加词）的后面，可用字母、符号、编号等自行决定。例如Ｂ.subtilis AS1.398和B.subtilisBF7.658是枯草杆菌的两个菌株，前者可生产蛋白酶，后者生产α－淀粉酶。

录入时间:2011-11-18 9:25:28 来源：互联网

鼠疫耶尔森氏菌、霍乱弧菌(包括EL-tor弧菌)、天花病毒、黄热病毒(黑毒株)、出血热(克里米亚刚果出血热)病毒、东、西方马脑炎病毒、委内瑞接马脑炎病毒、拉沙热(Lassa)病毒、马堡(Marburg)病毒、埃波拉(Ebola)病毒、猴疱疹病毒(猴B病毒)；粗球孢子菌、荚膜组织胞浆菌、杜波氏组织胞浆菌。

2 中度危害性

土拉弗郎西丝氏菌、布氏菌、炭疽芽胞菌、肉毒梭菌、鼻疽假单胞菌、类鼻疽假单胞菌、麻风分枝杆菌、结核分枝杆菌。狂犬病病毒(街毒)、森林脑炎病毒、流行性出血热病毒、国内尚未发现病人在国外引起脑脊髓炎及出血热的其它虫媒病毒、登革热病毒、甲、乙型肝炎病毒；各种立克次氏体(包括斑疹伤塞、Q热)；鹦鹉热、乌疫衣原体、淋巴肉芽肿衣原体；马纳青霉、北美芽生菌、付球孢子菌、新型隐球菌、巴西芽生菌、烟曲霉。

3 低度危害性

脑膜炎奈瑟氏菌、肺炎双球菌、葡萄状球菌、链球菌、淋病奈瑟氏菌及其它致病性奈瑟氏菌、百日咳博德特氏菌、白喉棒杆菌及其它致病性棒杆菌、流感嗜血杆菌、沙门氏菌、志贺氏菌、致病性大肠埃希氏菌、小肠结肠炎耶尔森氏菌、空肠弯曲菌、酵米面黄杆菌、付溶血性弧菌、变形杆菌、李斯特氏菌、铜绿假单孢菌、气肿疽梭菌、产气荚膜梭菌、破伤风梭菌及其它致病梭菌；钩端螺旋体、梅毒螺旋体、雅司螺旋体。乙型脑炎病毒、脑心肌炎病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒以及未列入一、二类的其它虫媒病毒、新必斯(Sindbis)病毒、滤泡性口炎病毒、流感病毒、付流感病毒、呼吸道合胞病毒、腮腺炎病毒、麻疹病毒、脊髓灰质炎病毒、腺病毒、柯萨奇(A及B组)病毒、艾柯(ECHO)病毒及其它肠道病毒、疱疹类病毒(包括单纯疱疹、巨细胞、EB病毒、水痘病毒)、狂犬病固定毒、风疹病毒；致病性支原体；黄曲霉、梨孢镰刀菌、蛙类霉菌、放线菌属、奴卡氏菌属、石膏样毛癣菌(粉型)、孢子丝菌。

4 微度危害性

生物制品、菌苗、疫苗生产用各种减毒、弱毒菌种及不属于上述三类的各种低致病性的微生物菌种。