保存生海蛎子有多种办法。冷藏保存时，先将海蛎子用清水洗净，沥干水分后装入保鲜袋或保鲜盒，放入冰箱冷藏室，温度调至0-5℃，这样能保存1-2天，可保持较好的新鲜度和口感。
冷冻保存适合较长时间保存。同样洗净海蛎子后，将其单个或多个装入密封袋，尽量排出空气，放入冰箱冷冻室，温度调至-18℃左右，能保存几个月。不过冷冻后的海蛎子口感会有所变化，肉质可能不如新鲜时嫩滑。
还有海水浸泡法，若有海水，将海蛎子放入装有海水的容器中，让其在海水中存活，可保存1-2天，能维持海蛎子的鲜活状态。若没有海水，也可用盐水代替，调配与海水浓度相近的盐水，以延长保存时间。
