广州南站东进站口和西进站口存在一些不同点。
位置上，东进站口位于车站东侧，西进站口在车站西侧，所处方位不同，这决定了乘客从不同方向前往车站时，选择不同进站口更为便捷。比如，来自番禺东部方向的乘客选择东进站口可能更节省时间；而从佛山等西部方向来的乘客，西进站口或许是更好的选择。
周边交通配套有差异。东进站口周边可能公交线路、停车场布局与西进站口周边不同。有些停车场可能距离东进站口更近，方便在此停车后快速进站；而西进站口附近可能公交线路更密集，对于乘坐公交前来的乘客更有利。
进站后的内部布局和引导也有区别。进入东进站口后，到达特定候车区域、检票口的路线与西进站口不同。不同车次的检票口可能更靠近某一侧进站口，乘客若不了解，可能会因选择错误进站口而多走弯路。例如部分开往深圳方向的车次检票口可能离东进站口更近。
