广州南站东进站口与西进站口存在一些区别。
位置上，东进站口位于车站东侧，西进站口在车站西侧。这使得从不同方向前来的旅客，可依据自身位置和交通便利性选择更近的进站口，以节省时间和路程。比如在番禺区东部的旅客，选择东进站口可能更便捷；而在番禺区西部的旅客，西进站口或许是更好的选择。
进站后的功能布局也有差异。东进站口周边可能配套有特定的商业设施、服务区域；西进站口附近的商业业态、服务设置可能有所不同。部分旅客可能会发现，东进站口附近餐饮种类丰富，而西进站口周边便利店较多。
进站后的候车区域也不同。从东进站口进入后，引导至的候车区域可能对应特定车次；西进站口进入后的候车区域则对应另外一些车次。旅客需根据所乘车次，按照站内指示牌，前往相应候车区候车。 不过，两个进站口都能顺利进入车站乘车，旅客只需提前了解自己的车次信息和车站布局，选择合适进站口即可。
