G1339次列车途经的站点包括：重庆西、息烽、贵阳东、贵定北、凯里南、铜仁南、怀化南、新化南、邵阳北、娄底南、长沙南、萍乡北、新余北、南昌西、鹰潭北、上饶、衢州、金华、杭州东，最终到达上海虹桥。以上就是G1339次列车途经的全部站点。
