沙糖桔保存要达到最佳效果，可根据不同情况选择保存方法。
家庭少量保存时，可先将沙糖桔表面水分擦干，防止细菌滋生。接着用保鲜袋或保鲜膜逐个包裹，尽量排出空气，再放入冰箱冷藏，温度调至2 - 4℃左右，这种方法能抑制微生物生长和水分流失，可保存1 - 2周。
若是大量保存，地窖保存是不错选择。先将地窖打扫干净，用石灰水喷洒消毒。把沙糖桔装入筐中，码放在地窖内，定期检查，挑出坏果，能保存几个月。
也可采用松针保存法，在容器底部铺一层新鲜松针，放上一层沙糖桔，再铺一层松针，如此重复，置于阴凉通风处，松针能起到保鲜和防潮作用，可保存一段时间。
