预制菜保存方式因类型而异。冷藏保存适合大部分短保质期预制菜，一般温度在0-8℃。像一些含新鲜蔬菜、肉类且加工后未经过深度杀菌处理的预制菜，比如家常炒菜类预制菜，放入冰箱冷藏，能抑制微生物生长繁殖，可保存数天到一周左右。
冷冻保存适用于多种预制菜，温度通常在-18℃以下。对于有较多肉类、海鲜的预制菜，以及一些面点类预制菜，冷冻能长时间保持其品质，可保存几个月甚至更久。比如预制的水饺、汤圆等，冷冻后能防止馅料变质和面皮干裂。
常温保存的预制菜通常经过特殊处理，如高温杀菌、添加适量防腐剂等，这类预制菜一般包装密封良好。像一些罐头类预制菜，在未开封情况下，常温保存可达数月甚至数年。但开封后，应尽快食用，剩余部分需冷藏。
此外，保存预制菜要注意原包装保存，若原包装损坏，可用保鲜袋或密封容器重新包装，减少空气进入。同时，要按产品说明的保存条件和期限处理，确保预制菜的安全与品质。
