吉尔吉斯斯坦位于中亚东北部。它北邻哈萨克斯坦，西接乌兹别克斯坦，西南毗连塔吉克斯坦，东南部与中国接壤。
其领土东西长约 1600 公里，南北宽约 400 公里。地处天山山脉西段，境内多山，约 90% 的领土海拔在 1500 米以上，其中天山山脉和帕米尔－阿赖山脉绵亘于中吉边境。这种地形使得吉尔吉斯斯坦拥有壮丽的高山景观和丰富的山地生态系统。
该国境内还有众多河流湖泊，伊塞克湖是其最著名的湖泊，也是世界上较大的高山湖泊之一，湖水终年不冻，风景秀丽。
吉尔吉斯斯坦特殊的地理位置使其成为连接东西方的重要通道，在古代丝绸之路中就占据重要地位，如今在中亚地区的地缘政治和经济交流中也有着不可忽视的作用 。
