京东自营店以正品保证著称，相较于其他平台，其商品的可信度较高。然而，这并不意味着所有商品都能保证是正品。京东自营店由京东官方直接负责售后和销售，采取的是商家到买家的直接销售模式。商品服务若显示由京东发货并提供售后，或由厂家直接发货，均属于自营店。京东自营注重品牌形象，因此其商品相对更有保障。但这也并不意味着京东自营店的商品都是正品，只是在概率上，大部分商品还是值得信赖的。
旗舰店与京东自营店不同。旗舰店如同品牌租用超市柜台，商家以自有品牌或授权形式在京东开设店铺。而京东自营店则像超市，代理多种商品，厂家可能直接将产品卖给京东或与之合作，由京东销售。
物流方面，京东自营店通常选择最近的仓库发货，次日送达。而官方授权店或旗舰店则可能因配送点固定，物流速度相对较慢。
到货速度方面，京东自营店非常快，下单后数小时内即可送达。例如，晚上11点前下单，第二天早上9点左右可送达；早上9点前下单，下午即可送达。
