日本清酒的保存时长因多种因素而异。未开封的清酒，若在适宜条件下，一般能保存2到3年。普通的一般清酒，在常温（15℃左右）且避免阳光直射的环境中，可保存约2年；而一些高品质、经过特殊酿造工艺的纯米大吟酿等清酒，若储存得当，在5℃到15℃的低温环境下，保存3年也能较好地保持风味。
已开封的清酒，保存时间会大幅缩短。清酒接触空气后，容易氧化变质，风味会逐渐散失。如果将开封后的清酒密封好，放入冰箱冷藏（2℃到10℃），大约能保存1到2周。但随着时间推移，口感和香气仍会慢慢变差。
不同类型清酒的保存时长也有差别。比如生酒，由于未经过杀菌处理，微生物活性较强，保存时间较短，未开封时在低温下通常只能保存几个月；而经过高温杀菌处理的普通清酒，相对保存时间会长一些。
