燕窝保存不一定完全依靠冰箱，这取决于燕窝的状态。
干燕窝比较好保存，只要放在通风干燥处，避免阳光直射和受潮即可。通常可以将其用密封袋或密封容器装好，放在阴凉的柜子里，这样能保存较长时间，一般不用放入冰箱。不过，在潮湿的环境中，为防止燕窝发霉，也可放进冰箱冷藏，温度调至 2-5℃，能延长保质期。
而泡发后的燕窝，由于含水量增加，容易滋生细菌，应尽快食用。如果不能及时吃完，建议用干净容器密封好，放入冰箱冷藏，可保存 1-2 天。炖煮好的燕窝同样适合冷藏保存，能存放 3-7 天，要是想保存更久，也可冷冻，能存几个月，但冷冻后的燕窝口感可能会有所变化。
