判断玉髓真假可以从多方面入手。从透明度看，天然玉髓透明度较高，呈微透明至半透明状态，质地纯净温润，假玉髓可能过于透明或浑浊不清。观察颜色，天然玉髓颜色自然，分布有过渡，常见的有白、蓝、绿等色，假玉髓颜色往往过于鲜艳均匀，像染色玉髓颜色浮于表面，没有自然的深浅变化。
从质地方面，天然玉髓质地细腻，用手触摸有温润顺滑感，内部可能含有少量自然形成的包裹体或纹理；假玉髓多由玻璃等材质仿制，手感发涩，内部可能有气泡，纹理也不自然。
还可以通过硬度判断，玉髓硬度在6.5 - 7度左右，用硬度低于它的物品划其表面，天然玉髓不会留下明显痕迹，若轻易划出痕迹很可能是假的。
此外，借助仪器也能辅助判断，如用查尔斯滤色镜观察，天然玉髓在镜下无明显变化，染色玉髓可能会有颜色反应；专业的宝石鉴定仪器能更准确分析其成分结构。不过，对于难以判断的玉髓，最好送到专业鉴定机构出具权威鉴定证书。
