在通关手续办理方面，FOB和EXW存在明显区别。
EXW即工厂交货，是指卖方在其所在地或其他指定地点将货物交给买方处置时，即完成交货。在这种术语下，买方要承担自卖方所在地将货物运至预期目的地的全部费用和风险，办理出口和进口清关手续的责任也基本都落在买方身上。卖方通常没有义务协助买方办理通关手续，不过若买方有要求且承担风险和费用，卖方可以提供一定协助。
FOB是船上交货，卖方需在指定装运港将货物交到买方指定的船上，当货物在装运港越过船舷时，卖方即完成交货义务。在通关手续办理上，卖方负责办理货物的出口清关手续，提供出口许可证或其他官方批准文件，承担货物出口所需的一切海关手续费用及出口应缴纳的一切关税、税款和其他费用；而买方则负责办理货物的进口清关手续，承担进口关税及其他进口费用。
总之，EXW术语下通关手续办理主要由买方负责，卖方协助有限；FOB术语下卖方负责出口清关，买方负责进口清关 。
