正常情况下，榴莲本身无毒，可安全食用。不过，在一些特殊情形下，榴莲可能存在“有毒”风险。
若榴莲保存不当，受到细菌、霉菌等微生物污染，微生物大量繁殖过程中会产生毒素，食用后可能引发食物中毒，出现腹痛、腹泻、呕吐等症状。比如在高温环境下，榴莲露天放置过久，就容易被污染变质。
还有，榴莲与某些药物可能存在相互作用。像榴莲含有丰富的呋喃香豆素，这种物质会影响人体对一些药物的代谢。若食用榴莲后马上服用降压药、降脂药、安眠药等，可能导致药物在体内浓度异常升高，增强药物不良反应，严重时危及生命。
对榴莲过敏者接触或食用榴莲，身体免疫系统会将其识别为外来有害物质，引发过敏反应，症状从轻微皮肤瘙痒、皮疹到严重呼吸道水肿、过敏性休克不等，从这个角度讲也类似“中毒” 。
