巧克力有可能发霉。巧克力保存不当就会给霉菌滋生创造条件。当环境湿度较高时，比如相对湿度长时间超过65%，巧克力表面容易吸附水汽，为霉菌生长提供水分。而且如果存放温度不合适，在温暖环境中，霉菌的活性增强，繁殖速度加快，巧克力就更易发霉。
像黑巧克力、牛奶巧克力和白巧克力，在不良保存条件下都有发霉风险。黑巧克力含有的可可碱等成分虽有一定抗菌性，但湿度温度等条件恶劣时也难以抵御霉菌。牛奶巧克力因含有牛奶成分，营养丰富，更适合霉菌生长。白巧克力主要由可可脂、糖和牛奶等制成，同样易受霉菌侵害。
如果巧克力保存环境良好，如处于干燥、温度适宜（一般15 - 20℃）的地方，其发霉可能性会降低。但一旦保存条件变差，就可能出现发霉现象。
