水晶消磁石有多种正确使用方式。
日光消磁法较为常见，将水晶消磁石与需要消磁的水晶一起放在阳光下照射 3 - 4 小时。不过要注意，一些颜色鲜艳或质地较软的水晶，如紫水晶、粉晶等，不宜长时间暴晒，以免褪色或损伤。
月光消磁法也不错，在月圆之夜，把它们放在能被月光照射到的地方，让月光洒在上面一整晚。月光柔和，对各类水晶都比较适用。
流水消磁法是将水晶消磁石和水晶放在流动的清水下冲洗几分钟，水流能带走水晶的负面能量。但要留意水晶是否怕水，像电气石等怕水的水晶就不适合。
埋入土里也是一种方式，把水晶消磁石和水晶一起埋入干净的泥土中几个小时到一天不等，借助大地的力量进行消磁。
还有使用晶簇或晶洞消磁，将水晶放置在晶簇或晶洞内一段时间，通常 24 小时左右，晶簇和晶洞强大的能量场能有效净化水晶。详情
