马关县地处云南省东南部，文山壮族苗族自治州南部。它东与麻栗坡县相连，南与越南社会主义共和国接壤，国境线长138公里，西与红河哈尼族彝族自治州的河口瑶族自治县、屏边苗族自治县毗邻，北靠文山市。
马关县地势西北高、东南低，境内多为山地，地形起伏较大。海拔最高点是老君山主峰，海拔2579米；最低点是麻栗坡河与南溪河交汇处，海拔107米。
其气候属南亚热带季风气候类型，冬无严寒，夏无酷暑，温热多雨，干湿季分明。复杂多样的地理位置，使得马关县拥有丰富的自然资源，在农业、林业等方面具备一定发展优势，同时特殊的边境位置也让其在对外贸易、边境交流等方面有着独特地位 。
