杭州地铁5号线站点众多。
主线部分站点有金星站，位于余杭区，周边有一些住宅和商业配套。良睦路站，方便周边居民出行前往各处。杭师大仓前站，临近杭州师范大学，为师生和周边人员提供交通便利。永福站，处于发展中的区域，带动周边开发。五常站，周边商业氛围逐渐浓厚。蒋村站，周边有西溪银泰城等商业体。浙大紫金港站，方便浙江大学紫金港校区的师生出行。三坝站，是2号线与5号线的换乘站，加强了线路间的联系。萍水街站，周边多住宅小区。和睦站，周边生活设施齐全。大运河站，靠近大运河，有一定旅游资源。善贤站，方便周边居民日常出行。打铁关站，是1号线与5号线的换乘站，交通枢纽作用明显。宝善桥站，地处繁华地段。建国北路站，是2号线与5号线的换乘站。万安桥站，周边生活气息浓郁。城站站，与杭州城站火车站相连，方便旅客进出。南星桥站，是4号线与5号线的换乘站。长河站，周边产业园区较多。聚才路站，为周边上班族提供便利。创景路站，处于科技产业聚集区。
此外，5号线还有支线，支线站点包括老余杭站、金星站等，为余杭部分区域居民出行提供了便利。
