车厘子有被寄生虫感染的可能，但并非所有车厘子都有寄生虫。
果蝇的幼虫可能会寄生在车厘子中。果蝇通常在果实快成熟时，将卵产在车厘子表面，卵孵化后的幼虫会钻进果实内部。不过，这种情况并不普遍，而且果蝇幼虫对人体基本无害，即使不小心误食，一般也不会在人体内生存，会被胃酸消化分解。
车厘子仍然是可以放心食用的。在食用前，可将车厘子放在清水中浸泡15 - 20分钟，期间轻轻搅拌，让可能存在的杂质、幼虫等漂浮出来，之后再用流动的水冲洗干净。这样处理后的车厘子，既能享受美味，又能最大程度保障健康。所以不能因存在极小概率有寄生虫的情况，就拒绝食用营养丰富的车厘子。
