酱牛肉保存得最好的方式因保存时长而异。
短期保存（1-2天），可将酱牛肉放在干净的容器里，密封后置于冰箱冷藏室，温度调至0-4℃，这样能抑制细菌滋生，保持肉质鲜嫩和原有风味。
长期保存（超过2天），建议冷冻保存。先把酱牛肉自然放凉，用保鲜膜或保鲜袋包裹严实，尽量排出空气，防止水分流失和串味，再放入冰箱冷冻室，温度调至-18℃左右。食用时提前取出，放在冷藏室解冻或用微波炉解冻功能解冻。
若想保存更长时间且保持风味，可先将酱牛肉切成合适小块，放入保鲜袋并加入适量卤汁，排出空气后密封，再放入冷冻室。卤汁能防止牛肉在冷冻过程中变干变硬，解冻后口感更好。此外，保存酱牛肉的容器要干净无油无水，避免加速变质。
