生蚝可以通过冷冻来保存。冷冻能抑制微生物生长繁殖和酶的活性，延长生蚝的保鲜期。
在冷冻生蚝前，要先将其处理干净。若是带壳生蚝，需用刷子把外壳刷洗干净；若是生蚝肉，则要去除杂质并冲洗。处理好后，可将生蚝装入密封袋或保鲜盒，尽量排出空气，防止在冷冻过程中出现氧化和串味。
把装有生蚝的袋子或盒子放入冰箱冷冻室，温度调至 -18℃ 以下，这样能更好地保持生蚝的品质和口感。不过，冷冻后的生蚝口感会有所变化，不如新鲜时那般鲜嫩多汁。
冷冻的生蚝在烹饪前要提前取出解冻。可放在冰箱冷藏室缓慢解冻，也可用流动的冷水加速解冻。解冻后尽快烹饪，避免长时间放置导致变质。
