正常情况下，经过炒制等加工处理的可食用窝瓜子（南瓜子）是无毒的，人们可以放心食用，还有一定益处，比如能为人体补充蛋白质、不饱和脂肪酸等营养成分 。
但如果是未经处理的野生窝瓜（南瓜）种子，尤其是一些特殊品种或受到污染、变质的，可能存在一定风险。不过一般来说，南瓜本身并非剧毒植物，即便种子有毒性物质含量通常也较低。在特殊情况下，比如大量食用变质或受污染的窝瓜子，可能会引起胃肠道不适，出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状。不过这种情况比较少见，只要食用来源可靠、处理得当的窝瓜子，通常不会对健康造成严重威胁。
