徐州站与徐州东站在多方面存在不同。
位置上，徐州站位于徐州市鼓楼区津浦西路，处于徐州市中心区域附近；徐州东站则位于徐州市贾汪区鲲鹏路，地处城市东部。
规模方面，徐州东站规模较大，站场线路众多，站房面积也较大；徐州站规模相对较小。
在运营线路上，徐州站主要承担普速列车的运营，连接着众多国内城市；徐州东站主要负责高铁和动车的停靠，是京沪高铁等线路上的重要站点，让徐州与国内各大主要城市的时空距离大幅缩短。
乘车环境上，徐州东站作为新建车站，设施更为现代化，候车大厅宽敞明亮，各类指示标识清晰，配套设施如餐饮、购物等也更完善；徐州站由于建成时间较早，部分设施相对陈旧，但也在不断升级改造。
交通换乘方面，徐州东站周边规划了较为完善的交通换乘体系，有地铁、公交等多种交通方式无缝衔接；徐州站周边交通换乘体系也在不断优化，但因地处市中心，交通情况相对复杂。
