
表2总RNA一80℃保存1周前后浓度和A260/280值结果
三、RNA提取液一80℃保存时间的影响
73例总RNA样本在一80℃保存1周前后的测定数据的配对student’st—test结果(表2),提示总RNA标本在一80℃保存1周后由于冻融而略有降解。
图1总RNA样本的琼脂糖凝胶电泳结果
组别:A一新鲜全血,B一冻融1次全血,C一冻融2次全血
讨论
组问ANOVA方差分析结果提示.使用新鲜全血进行总RNA提取效果最佳:由于细胞内源的RNase在细胞破坏时才会释放并完全发挥作用151.故4℃下保存1周内的未溶血标本也可用。由于一80℃保存3个月的标本中获取的RNA浓度要远远高于一20cc保存2个月的标本f表1),所以当全血标本保存需超过2个月时,一80。C条件更佳。一80℃保存4个月的标本和一20℃保存2个月的标本中的总RNA的浓度已无显著性差异f表11。尽管低温可以抑制酶的活性.但即使在-200C甚至一80℃中.RNase还可以缓慢发挥功能。所以.如果不能在新鲜血标本获取1周内完成RNA的提取.无论全血标本保存时间长短.都应保存在一80℃,但即使保存在一80℃,需要进行RNA提取的全血标本保存时间最好不要超过4个月。
紫外吸光值A260/280比值代表了总RNA的纯度161.其范嗣在1.8~2.0时,表示RNA的纯度较好。从全血标本中获取的总RNA标本纯度相对较低.本研究中88.83%的实验样本A260,280比值<1.8.其原因为:①总RNA直接溶于水,低离子浓度可增加A280nm吸光值同,致A260/280值下降。②红细胞裂解过程中,红细胞内的蛋白会影响总RNA纯化,导致A280nm值的升高网。文献报道,NH4Cl裂解法在分离淋巴细胞过程中有去除红细胞的作用191.提示在总RNA提取中.可对标本进行红细胞二次裂解处理。从而减少红细胞碎片的量。
本研究选用变性琼脂糖凝胶电泳判断RNA完整性.此法快速、操作简便。在总RNA中,28s和18srRNA片断的比值代表了RNA的完整性IlOl。28s和18srRNA片断的过多降解.会造成下游研究应用的不准确。结果表明.尽管冻融会造成RNA完整性有所下降.但全血标本冻融2次不至于对RNA的完整性产生巨大影响。
已提取的总RNA在一80℃下保存l周再测定结果显示,总RNA浓度有所下降。所以逆转录过程如不能在总RNA提取、定量后立即进行时,建议后续进行逆转录操作前.重新对一80℃保存的总RNA冻融标本进行再定量测定。
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全血标本保存条件对人总RNA提取效率的影响
作者:穆龙龙, 赵志英, 朱立, MU Long-long, ZHAO Zhi-ying, ZHU Li
作者单位:中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院核医学科,100730
刊名:
北京医学
英文刊名:BEIJING MEDICAL JOURNAL
年,卷(期):2010,32(10)
被引用次数:2次
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引用本文格式:穆龙龙.赵志英.朱立.MU Long-long.ZHAO Zhi-ying.ZHU Li全血标本保存条件对人总RNA提取效率的影响[期刊论文]-北京医学 2010(10)
