鼻咽癌的临床分期检查至少要包括：常规体格检查、常规实验室检查、头颈部MRI和/或CT、胸部X线检查。另外还可以考虑腹腔B超和/或全身同位素骨骼扫描和内镜检查。由于手术并不是鼻咽癌的主要治疗方法，因此鼻咽癌的分期以临床分期为主。
鼻咽癌2003年UICC和AJCC联合制定的TNM分期法：
| 原发肿瘤（T）分期 | ||
| Tx | 原发肿瘤大小无法测量；或痰脱落细胞、或支气管冲洗液中找到癌细胞，但影像学检查和支气管镜检查未发现原发肿瘤 | |
| T0 | 没有原发肿瘤的证据 | |
| Tis | 原位癌 | |
| T1 | 肿瘤局限于鼻咽腔内 | |
| T2 | 肿瘤侵犯鼻腔和/或口咽 | |
| T2a | 无咽旁间隙侵犯 | |
| T2b | 有咽旁间隙侵犯 | |
| T3 | 肿瘤侵犯颅底骨质和/或鼻旁窦 | |
| T4 | 肿瘤侵犯颅内、脑神经、下咽、颞下窝、眼眶、咀嚼肌 | |
| 淋巴结转移（N）分期 | ||
| Nx | 淋巴结转移情况无法判断 | |
| N0 | 无颈淋巴结转移 | |
| N1 | 单侧颈淋巴结转移，最大径≤6cm，位于锁骨上窝以上部位 | |
| N2 | 双侧颈淋巴结转移，直径≤6cm，位于锁骨上窝以上部位 | |
| N3 | 颈淋巴结转移： | |
| N3a | 直径＞6cm； | |
| N3b | 锁骨上窝转移 | |
| 远处转移（M）分期 | ||
| Mx | 无法评价有无远处转移 | |
| M0 | 无远处转移 | |
| M1 | 有远处转移 | |
| Ⅰ期 | T1 | N0 | M0 |
| Ⅱa期 | T2a | N0 | M0 |
| Ⅱb期 | T1 | N1 | M0 |
| T2a | N1 | M0 | |
| T2b | N0-1 | M0 | |
| Ⅲ期 | T1 | N2 | M0 |
| T2a-2b | N2 | M0 | |
| T3 | N0-2 | M0 | |
| Ⅳa期 | T4 | N0-2 | M0 |
| Ⅳb期 | T1-4 | N3 | M0 |
| Ⅳc期 | T1-4 | N0-3 | M1 |
T
| 分期 | |
| T1 | 局限于鼻咽 |
| T2 | 侵犯鼻腔、口咽、咽旁间隙 |
| T3 | 侵犯颅底、翼内肌 |
| T4 | 侵犯颅神经、鼻窦、翼外肌及以外的咀嚼肌间隙、颅内（海绵窦、脑膜等） |
| N分期 | |
| N0 | 影像学及体检无淋巴结转移证据 |
| N1a | 咽后淋巴结转移 |
| N1b | 单侧Ⅰb、Ⅱ、Ⅲ、Ⅴa区淋巴结转移且直径≤3 cm |
| N2 | 双侧Ⅰb、Ⅱ、Ⅲ、Ⅴa区淋巴结转移，或直径＞3 cm，或淋巴结包膜外侵犯 |
| N3 | Ⅳ、Ⅴb区淋巴结转移 |
| M分期 | |
| M0 | 无远处转移 |
| M1 | 有远处转移（包括颈部以下的淋巴结转移） |
| 临床分期 | |
| Ⅰ期 | T1N0M0 |
| Ⅱ期 | T1N1a-1bM0，T2N0-1bM0 |
| Ⅲ期 | T1-2N2M0，T3N0-2M0 |
| Ⅳa期 | T1-3N3M0，T4N0-3M0 |
| Ⅳb期 | 任何T、N和M1 |
| 2008分期 | 1992年福州分期 | UICC分期 | |||
| T1 | 局限鼻咽 | 局限于鼻咽腔内 | 局限鼻咽腔内 | ||
| T2 | 侵犯鼻腔、口咽、咽旁间隙 | 局部侵犯鼻腔、口咽、软腭、颈椎前软组织、茎突前间隙，颈动脉区部分侵犯 | 侵犯至口咽和（或）鼻腔、咽旁间隙 | ||
| T3 | 侵犯颅底、翼内肌 | 颈动脉鞘区完全占据，颅底、翼腭窝、单一前组或后组颅神经损害 | 骨结构各（或鼻窦） | ||
| T4 | 侵犯颅神经、鼻窦、翼外肌及以外的咀嚼肌间隙、颅内（海绵窦、脑膜等） | 前后组颅神经同时受损，鼻窦、海绵窦、眼眶、颞下窝、第1、2颈椎侵犯 | 侵及颅内和（或）脑神经、颞下窝、下咽、眼眶或咀嚼肌间隙 | ||
| N1 | N1a | 咽后淋巴结转移 | 上颈肿大淋巴结且直径4＜cm，活动 | 锁骨上窝以上单侧颈部淋巴结转移，最大直径≤6cm， | |
| N1b | 单侧Ⅰb、Ⅱ、Ⅲ、Ⅴa区淋巴结转移且直径≤3cm； | ||||
| N2 | 双侧Ⅰb、Ⅱ、Ⅲ、Ⅴa区淋巴结转移，或直径＞3cm，或淋巴结包膜外侵犯； | 下颈肿大淋巴结或直径4-7cm，活动受限 | 锁骨上窝以上双侧颈部淋巴结转移，最大直径≤6cm， | ||
| N3 | Ⅳ、Ⅴb区淋巴结转移 | 锁骨上区肿大淋巴结或直径＞7cm，固定及皮肤浸润 | N3 a | 颈部转移淋巴结的最大直径＞6cm， | |
| N3 b | 锁骨上窝淋巴结转移 | ||||
| 原发肿瘤（T）分期 | ||
| Tis | 原位癌 | |
| Tx | 未发现癌灶 | |
| T1 | 肿瘤局限于鼻咽腔内 | |
| T2 | 肿瘤侵犯鼻腔、口咽、茎突前间隙、软腭、颈椎前软组织，颈动脉鞘部分侵犯 | |
| T3 | 颈动脉鞘区完全占据，颅底、翼腭窝、翼突区、单一前组或后组颅神经损害 | |
| T4 | 前后组颅神经同时受损，鼻窦、海绵窦、眼眶、颞下窝、第1、2颈椎侵犯 | |
| 淋巴结转移（N）分期 | ||
| N0 | 无颈淋巴结转移 | |
| N1 | 上颈肿大淋巴结且直径4＜cm，活动 | |
| N2 | 下颈有肿大淋巴结，或直径4-7cm，或活动受限 | |
| N3 | 锁骨上区有肿大淋巴结或直径＞7cm，或固定及皮肤浸润 | |
| 远处转移（M）分期 | ||
| M0 | 无远处转移 | |
| M1 | 有远处转移 | |
| 临床分期 | ||
| Ⅰ期 | T1 N0 M0 | |
| Ⅱ期 | T2 N0-1 M0，T1-2 N1 M0 | |
| Ⅲ期 | T3 N0-2 M0，T1-3 N2 M0 | |
| Ⅳa期 | T4 N0-3 M0，T1-4 N3 M0 | |
| Ⅳb期 | 任何T、任何N M1 | |
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