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虽然 MySQL 4.1.7 已经发布并成为官方推荐版本，但是 4.0.x 系列并没有停止更新和 bug 修复，其实现在服务器上的 MySQL 大多是 3.x 版本的，呵呵。
在更新到 4.1.17 版本的 MySQL 后，发现需要使用 MySQLi 扩展方能正常使用数据库，否则会出现 1251 - Client does not support authentication protocol requested by server; consider upgrading MySQL client 的提示，这个很纳闷，我没有研究具体的问题，只是切换到 MySQLi 扩展，其实在给 root 加上密码前还是可以使用 MySQL 扩展的，可是给 root 加上密码后就出现了上述客户端版本太低的提示。
目前已知解决方法：
先用root登录MYSQL服务器，执行
mysql>set password for user1@"localhost"=old_password(yourPassword);
原因是因为你使用的mysql服务器版本中使用了新的密码验证机制，这需要客户端的版本要在4.0以上，原来的密码函数被改为old_password();，这样使用password()生成的密码在旧的版本上的客户端就不好使了，而PHP中的MYSQL客户端都是3.23的(当然，mysqli的扩展除外)，问题就在这了。
更新信息：ChangeLog
下载：http://dev.mysql.com/downloads/mysql/4.0.html
php.cn/index.php?module=article&id=132" target=_blank>http://www.openphp.cn/index.php?module=article&id=132
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